后唐长兴四年（933年），自“山自永福里，水自清源里，会于治所”中取山水各一字，定名福清。
福清，简称融。唐圣历二年（公元699年），析长乐东南太平、感德、崇福、山亭、孝义、万安、长东、永乐8乡置万安县，隶于泉州（今福州）。天宝元年（742年）改名福唐县，隶于长乐郡（今福州）。元和三年（808年），长乐县并入福唐县。元和五年（810年），复析出置长乐县。后梁开平二年（908年）改名永昌县，隶福州。后唐同光元年（923年）复名福唐县。长兴四年（闽龙启元年，933年），以“山自永福里，水自清源里，会于治所”，改福唐为福清。隶长乐府（是年，福州升为长乐府）。两宋，福清县仍隶福州。其间，在北宋太平兴国五年（980年），曾改隶兴化军。太平兴国八年（983年），复隶福州。南宋景炎元年（1276年），升福州为福安府，福清县隶福安府。元初，福清县属福州路。元初，福清县属福州路。元贞元年（1295年），以户满四万，升为福清州，仍隶福州路。明洪武元年（1369年）复为县，隶福州府。南明隆武元年（1645年），隶天兴府。清代，福清县仍隶福州府。嘉庆三年（1798年），析福清县海坛岛地置平潭建军厅，直隶福州府。民国元年，福清县属东路道（民国三年，改称闽海道）。
1949年8月16日解放。历属福建省第四行政督察区（1949年9月）、闽侯专区（1950年）、晋江专区（1956年）、闽侯专区（1959年）、莆田地区（1971年）、福州市（1983年7月）。1990年12月26日国务院批准，撤销福清县，设立福清市（县级）。1991年5月5日正式挂牌。2005年底，撤销音西、阳下、宏路、融城等3个镇、1个街道，析出海口镇8个村委会，整合设立玉屏、龙山、龙江、音西、宏路、石竹、阳下7个街道办事处。
